Deep Learning models are easily disturbed by variations in the input images that were not seen during training, resulting in unpredictable behaviours. Such Out-of-Distribution (OOD) images represent a significant challenge in the context of medical image analysis, where the range of possible abnormalities is extremely wide, including artifacts, unseen pathologies, or different imaging protocols. In this work, we evaluate various uncertainty frameworks to detect OOD inputs in the context of Multiple Sclerosis lesions segmentation. By implementing a comprehensive evaluation scheme including 14 sources of OOD of various nature and strength, we show that methods relying on the predictive uncertainty of binary segmentation models often fails in detecting outlying inputs. On the contrary, learning to segment anatomical labels alongside lesions highly improves the ability to detect OOD inputs.
translated by 谷歌翻译
深度神经网络已成为3D医学图像自动分割的金标准方法。然而，由于缺乏对所提供的结果评估可理解的不确定性评估，他们被临床医生的全部接受仍然受到阻碍。量化其不确定性的大多数方法，例如流行的蒙特卡洛辍学物，仅限于在体素水平上预测的某种不确定性度量。除了与真正的医学不确定性无关紧要之外，这在临床上并不令人满意，因为大多数感兴趣的对象（例如，脑部病变）是由素食组成的，其整体相关性可能不会简单地减少其个人不确定性的总和或平均值。在这项工作中，我们建议使用创新的图形神经网络方法超越体素评估，并从蒙特卡洛辍学模型的输出中训练。该网络允许融合体素不确定性的三个估计量：熵，方差和模型的置信度；并且可以应用于任何病变，无论其形状或大小如何。我们证明了我们方法对多发性硬化病变的任务的不确定性估计的优势。
translated by 谷歌翻译
神经网络在压缩体积数据以进行科学可视化方面表现出巨大的潜力。但是，由于训练和推断的高成本，此类体积神经表示仅应用于离线数据处理和非交互式渲染。在本文中，我们证明，通过同时利用现代的GPU张量核心，本地CUDA神经网络框架以及在线培训，我们可以使用体积神经表示来实现高性能和高效率交互式射线追踪。此外，我们的方法是完全概括的，可以适应时变的数据集。我们提出了三种用于在线培训的策略，每种策略都利用GPU，CPU和核心流程技术的不同组合。我们还开发了三个渲染实现，允许交互式射线跟踪与实时卷解码，示例流和幕后神经网络推断相结合。我们证明，我们的体积神经表示可以扩展到Terascale，以进行常规网格体积可视化，并可以轻松地支持不规则的数据结构，例如OpenVDB，非结构化，AMR和粒子体积数据。
translated by 谷歌翻译
在过去的十年中，出现了一些用于超参数搜索的新型框架，但大多数依赖于严格的，通常是正常的分布假设，从而限制了搜索模型的灵活性。本文提出了一个基于共形预测的新颖优化框架，假设仅交换性，并允许更大的搜索模型体系结构和方差估计器选择。在密集和卷积神经网络上探索和基准测试了几个这样的模型，并在最终的损失和成就时间中都表现出色。
translated by 谷歌翻译
尽管对临床机器学习研究有强烈的关注和相当大的投资，但在现实世界的临床环境中，在大规模的应用中已经部署了相对较少的应用。虽然研究在推进最先进的情况下很重要，但翻译同样重要的是，使这些技术和技术能够最终影响医疗保健。我们认为对几个考虑缺乏升值是在期望和现实之间这种差异的主要原因。为了更好地描述研究人员和从业者之间的整体视角，我们调查了几个从业人员在开发CML中进行临床部署的商业经验。使用这些洞察力，我们确定了几个主要类别的挑战，以便更好地设计和开发临床机学习应用。
translated by 谷歌翻译